の駅一覧（正式名称: 九州新幹線）

JR九州による運行路線

博多

↔ (JR西日本)

↔ JR福北ゆたか線 (JR九州)

↔ (福岡市交通局)

↔ (福岡市交通局)

↔ (JR西日本)

新鳥栖

久留米

↔ JRゆふ高原線 (JR九州)

筑後船小屋

新大牟田

新玉名

熊本

↔ JR阿蘇高原線 (JR九州)

↔ JR三角線（あまくさみすみ線） (JR九州)

↔ (熊本市交通局)

新八代

新水俣

↔ (肥薩おれんじ鉄道)

出水

↔ (肥薩おれんじ鉄道)

川内

↔ (肥薩おれんじ鉄道)

鹿児島中央

↔ (鹿児島市交通局)